ポケ３では、以下の３つの内蔵ソフトがバージョン管理されています。
このうち、DOSについては、バージョンは3.1固定であり、管理されているのはパッチレベル部分です。パッチレベルが違うと何が異なるのかという点については、残念ながら資料がありません。
以下に、OASYSシステムとAutoComのバージョン間の差異について、私の把握できた範囲でまとめてみました。
| 01-001 | ROM内に収められているバージョン。システムを初期化（応急復旧）した場合などにお目にかかることがある。ほとんど使われていないこともあって、既知の不具合はないが、逆に言うと、どんな不具合が埋め込まれているかがわからないだけに不安があるかも。 |
| 01-004 |
電源が不安定なとき（電池マーク点滅時や、シャットダウン時）にシステムが飛ぶことが多い（らしい） 01-008にしたら体感的にシステムの安定性がかなり向上したとの報告あり |
| 01-008 | AutoComのE01V008に対応 |
| 01-009 | AutoComのE01V009に対応 |
| 01-010 |
1999年1月ごろにはリリースされていた模様（未確認情報） 1999年7月下旬に富士通でシステムを入れてもらったらこのバージョンになったとの報告あり |
| 01-040 | 2000年2月中旬に富士通でシステムを入れてもらったらこのバージョンだったと報告あり |
| 01-041 |
2000年2月下旬にリリースされる
システム01-009と01-041の差は、OASYS文書とDOSファイル交換、読み出し機能の修正のみ
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| E01V004 | 単語登録に際して、OASYSモードで横拡大文字を登録しようとするとハングアップ |
| E01V005 |
安定度が悪かった（よくシステムが消失した）という報告あり プリンタ関係のデバイスドライバをはずしてpICoを使用するとシステムが異常になったという報告あり（未確認情報） |
| E01V006 |
1994年9月中下旬リリース キーリピートあり |
| E01V008 |
1994年9月下旬リリース その前のバージョン（E01V006?）ではDOSモードでECSを使用して25行モードにしているときにSETUP.EXEを使用するとハングアップ 標準ではキーリピートしない なお、当時のOASYS専用機は文字キーに関してはキーリピート無しが標準 そのため、ポケ３はDOSモードであってもキーリピートしないのが本来の仕様であったらしい |
| E01V009 |
1995年7月中旬リリース システムデータが公開された最後のバージョン |
| E01V010 |
1999年11月ごろに富士通でシステムを入れてもらうとこのバージョンになったらしい（未確認情報） DOSフォーマットされたメモリカードにOASYSの新しいバージョンで記録された文書がポケ３で読み出せない、というバグが修正されている |
| E01V023 |
このバージョンはキーリピートする E01V008のマシンで電源ONの状態からACアダプタをいきなり引き抜いたらシステムが消失し、このバージョンとなった例あり このバージョンではファイル書き出しが不安定な模様で、AutoComのログをSRAMカードに記録するようにしていたときに、SRAMカードのデータが壊れてしまうという複数の報告がある。 |